Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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SYCP1Q15431 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYCP1Q15431 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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