Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRKQ15262 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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