Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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COL19A1Q14993 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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COL19A1Q14993 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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COL19A1Q14993 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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COL19A1Q14993 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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COL19A1Q14993 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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COL19A1Q14993 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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COL19A1Q14993 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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COL19A1Q14993 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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COL19A1Q14993 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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COL19A1Q14993 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COL19A1Q14993 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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COL19A1Q14993 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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