Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB39AQ14964 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB39AQ14964 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms