Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKAP5Q14008 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms