Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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SHROOM2Q13796 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
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SHROOM2Q13796 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SHROOM2Q13796 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
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