Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CUL4BQ13620 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CUL4BQ13620 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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