Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPM6BQ13491 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms