Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TCIRG1Q13488 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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