Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LSAMPQ13449 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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