Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE3BQ13370 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
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