Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SGCGQ13326 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SGCGQ13326 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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