Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NME3Q13232 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME3Q13232 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME3Q13232 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME3Q13232 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME3Q13232 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME3Q13232 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME3Q13232 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME3Q13232 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NME3Q13232 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
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