Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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NFIAQ12857 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFIAQ12857 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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