Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TROQ12816 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TROQ12816 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TROQ12816 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
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