Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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EFEMP1Q12805 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFEMP1Q12805 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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