Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP1B1Q10567 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP1B1Q10567 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms