Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPAL4Q0D2K0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms