Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CD164Q04900 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CD164Q04900 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
CD164Q04900 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CD164Q04900 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms