Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLOD1Q02809 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms