Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF8Q02556 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF8Q02556 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF8Q02556 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IRF8Q02556 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms