Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OTUD4Q01804 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms