Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BEX3Q00994 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms