Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDC42EP1Q00587 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms