Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERVK_113P62684 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P62684 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms