Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms