Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ERVFRD-1P60508 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms