Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEC13P55735 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC13P55735 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC13P55735 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms