Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HIRAP54198 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIRAP54198 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIRAP54198 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms