Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CRIP1P50238 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms