Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP4P49662 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP4P49662 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CASP4P49662 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms