Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA4P43681 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms