Protein–RNA interactions for Protein: P43378

PTPN9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN9P43378 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPN9P43378 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN9P43378 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN9P43378 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN9P43378 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN9P43378 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN9P43378 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN9P43378 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPN9P43378 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPN9P43378 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms