Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP8P40818 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP8P40818 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP8P40818 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms