Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP5DP30049 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP5DP30049 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms