Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LMO1P25800 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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