Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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PTPRZ1P23471 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PTPRZ1P23471 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PTPRZ1P23471 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PTPRZ1P23471 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PTPRZ1P23471 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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PTPRZ1P23471 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRZ1P23471 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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