Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRCP23327 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRCP23327 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRCP23327 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRCP23327 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms