Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT1P21579 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT1P21579 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT1P21579 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT1P21579 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms