Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRHP20396 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRHP20396 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRHP20396 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRHP20396 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms