Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NFKB1P19838 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NFKB1P19838 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NFKB1P19838 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NFKB1P19838 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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NFKB1P19838 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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NFKB1P19838 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NFKB1P19838 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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NFKB1P19838 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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NFKB1P19838 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NFKB1P19838 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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