Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ESRRAP11474 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ESRRAP11474 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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