Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LAMC1P11047 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms