Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRAPPC2BP0DI82 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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