Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C4BP0C0L5 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms