Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POLBP06746 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POLBP06746 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLBP06746 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms