Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBX6O95503 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBX6O95503 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX6O95503 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX6O95503 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX6O95503 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX6O95503 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX6O95503 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX6O95503 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX6O95503 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX6O95503 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX6O95503 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBX6O95503 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms