Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CTDSP2O14595 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms