Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRTO14522 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRTO14522 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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