Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVV-1B6SEH8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms